根据铁道部统一的部署，12月21日零点起，上海铁路局调整优化部分列车运行图。由于京沪线卧铺动车组将从12月21日起上线运营，受到卧铺动车影响，南京站部分列车到发时刻将作相应调整。
南通方向的两趟列车有望增加停靠站。上海至南通的T782/3、T784/1有望增加姜堰站；南京至南通的5096/7、5098/5有望增加江都站。另外上海-西安新增的Z92/3次列车，中途仅停靠无锡站，不再停靠南京站，明年春运西北方向车票将更显紧俏。
南京站部分列车12月21日起“小调图”
上海-洛阳1658次将由现在南京站22:48发车时间，提前到21:00发车，终到洛阳站时间，也由现在次日9:45，推迟到9:58。
南京西-北京T66次调整为22:17从南京西发车，次日9:29到北京，比现在到达北京时间推迟12分钟。
兰州-南京西T112/3次将延伸至杭州站，不再进南京西站。T112次杭州站10:30开，南京站由现在16:40提前至16:07开车。调整后的杭州-兰州的T112次，南京站作为过路站，原南京站的始发票额将大大削减。
南京西-成都1432/3次升级为K676/7次，南京西、南京站的开点仍为20:02和20:27，到达成都则由第3日的8:13提前至7:28，全程运行时间缩短了45分钟。
宁波-包头K256/5次列车将升级为T282/1次，运行区段改为杭州至包头间运行。T282次在南京站为23:52开车，沿途停靠徐州、济南、天津西、北京西、张家口南、大同、集宁南、呼和浩特，终到包头为第2天23:40；T281次在南京站9:46开车，沿途停靠常州、苏州、上海南，终到杭州站为14:49。
